|
В
суперкомпьютерном вычислительном центре НАН Украины
увеличена
мощность кластерной системы СКИТ-1. Модернизацией центра занимались
Институт кибернетики им. В.М.Глушкова НАНУ, Российская компания
"Т-Платформы" и украинская фирма Entry.
Суперкомпьютерный вычислительный центр (СВЦ) был создан в декабре
2004 года на базе двух высокопроизводительных кластерных систем
СКИТ-1 и СКИТ-2 - 16-узлового кластера на базе процессоров Intel
Xeon и 32-узлового на базе процессоров Intel Itanium 2.
Компания
"Т-Платформы" разработала
дизайн новых вычислительных узлов для кластера СКИТ-1 на базе
процессоров Intel Xeon, а также предложила заменить системную сеть
SCI на более производительный интерконнект стандарта InfiniBand.
Количество вычислительных узлов кластера СКИТ-1 было доведено до 24,
за счет чего пиковая производительность системы увеличилась до 255,4
Гфлопс (млрд. операций в секунду). За сборку и поставку восьми новых
двухпроцессорных узлов на базе процессоров Intel Xeon отвечали
Институт кибернетики НАНУ и компания Entry.
Интеграция новой системной сети InfiniBand позволила увеличить
реальную производительность кластера на тесте Linpack до 74% от
пиковой (189,4 Гфлопс), в то время как сеть SCI обеспечивала лишь
66%. Новая системная сеть также решила проблемы производительности
прикладного ПО кластера, такого как пакеты молекулярной динамики
и квантовой химии (GROMACS и GAMESS).
Сегодня
СВЦ НАНУ занимается такими задачами, как предотвращение
экологических катастроф, обработка и интерпретация геофизических
данных для разведки нефти и газа, моделирование и прогнозирование
погоды и последствий вредных выбросов в атмосферу. СВЦ также
обрабатывает космические съемки спутника "Метеостат" для
прогнозирования облачности и развития чрезвычайных метеорологических
ситуаций. Расчеты Института кибернетики обеспечивают эффективное
использование спутника СІЧ-ІМ и оптимальный выбор орбит и
планирование работы спутников дистанционного зондирования Земли.
Кроме
того, к вычислительным мощностям СВЦ прибегают и сторонние
организации. К примеру, Институт молекулярной биологии и генетики
НАНУ проводит расчеты на кластере СКИТ-1 с применением ПО GROMACS и
GAMESS для изучения синтеза молекул белка в организме человека и
исследования механизмов образования раковых клеток.
|
